Người chơi điều khiển một đội bốn thành viên thuộc lực lượng Quân đoàn Hàng không Đặc biệt (SAS) của Anh thực hiện một số nhiệm vụ quan trọng trong Thế chiến II. Trò chơi đưa ra tính năng lựa chọn người lính trước mỗi nhiệm vụ. Trình tự giảm tải toàn diện cũng có sẵn khi người chơi có quyền tiếp cận nhiều loại vũ khí và trang bị. Những lời chỉ dẫn về nhiệm vụ phác thảo các mục tiêu, trí thông minh về sức mạnh của kẻ thù và các kế hoạch được đề xuất về bước tiến quân. Trong quá trình thực hiện nhiệm vụ, người chơi có thể chỉ huy trực tiếp bằng cách chuyển đổi qua lại giữa các binh sĩ trong đội hình, ra lệnh bằng giọng nói hoặc bản đồ chiến thuật cho phép điều khiển thời gian thực hoặc điều động theo kế hoạch khi thoát ra khỏi bản đồ. Các nhiệm vụ bao gồm, phá hoại, tìm kiếm và phá hủy, giải cứu tù binh và hỗ trợ quân kháng chiến. Hidden & Dangerous có nhiều nhiệm vụ rải rác ở Ý, Nam Tư, Đức, Na Uy, Biển Bắc và Tiệp Khắc. Mặc dù có một số quyền tự do lịch sử được thực hiện với các nhiệm vụ và dòng thời gian thực tế của SAS, trò chơi vẫn giữ được độ chính xác về mặt lịch sử và bầu không khí căng thẳng, bao gồm cả vết thương thực tế khi các thành viên trong đội có thể bị thương nặng hoặc bị giết bởi ngay cả sự tiếp xúc ngắn với quân địch.